Entre las funciones principales del Equipo Científico figuran las de promover y desarrollar proyectos de investigación, ofrecer asesoría científica en el ámbito de actividad del Jardín Botánico Atlántico; y determinar la naturaleza y coherencia científica de las colecciones botánicas. El Equipo Científico también coordina la formación académica de postgrado en el Botánico y la participación del espacio en redes nacionales e internacionales y de conservación de plantas.